发现和描述未知物种是植物分类学研究的重要内容。植物所科研人员在广泛采集、深入调查和系统研究的基础上，发现了大量新类群，建立了3个新科、2个新亚科、4个新族、18个新属、5个新亚属和5个新组，发现116个新种，出版了Peonies of the World、《中国藓类植物属志》、《中国石松类和蕨类植物》、《中国凤仙花》、《中国苦苣苔科植物》、《中国杓兰属植物》等系列专著。目前，植物所正牵头有15个国家参与的重大国际合作项目“Flora of Pan-Himalaya的编研”。该志书由剑桥大学出版社和科学出版社联合出版，计划出版50卷、80分册，将是世界上最大、最有特色的自然地理区植物志。 

《泛喜马拉雅植物志》阶段性成果获央视报道