系统进化领域

　　    系统与进化植物学研究中心

　　 　 系统与进化植物学国家重点实验室

生态环境领域

　　　 植物生态学研究中心

　　　 植被与环境变化国家重点实验室

　　　 内蒙古锡林郭勒草原生态系统国家野外观测研究站

　　　 内蒙古鄂尔多斯草地生态系统国家野外观测研究站

　　　 湖北神农架森林生态系统国家野外观测研究站

现代农业领域

　　　 发育生物学研究中心

　　　 光合作用研究中心

　　　 信号转导与代谢组学研究中心

　　　 中国科学院光合作用与环境分子生理学重点实验室

植物资源领域

　　　 能源植物研发中心

　　　 中新联合实验室

　　　 中国科学院植物研究所北京植物园

　　　 中国科学院植物研究所华西亚高山植物园